شهید مصطفی کوچکی، در اولین روز از خردادماه سال 1334 در روستای خان‌آباد از توابع شهرستان خمین، دیده به جهان گشود. در زمان کودکی و جوانی از نظر اخلاقی بسیار خوب بود تا اینکه به سن 6 سالگی رسید و به مدرسه رفت و تا کلاس هفتم دبیرستان «نظام قدیم» تحصیل نمود. هم‌زمان با تحصیل در کنار پدر در مزرعه کشاورزی می‌کرد. پس از ترک تحصیل برای یافتن کاری مناسب به تهران رفت و به اتفاق برادرش در یک کارگاه جوشکاری مشغول به کار شدند و پس از یافتن مهارت لازم در شهر خمین یک کارگاه لوله‌کشی و جوشکاری راه‌اندازی کردند.

در زمان انقلاب در تهران فعالیت می‌کرد و بعد از پیروزی انقلاب اسلامی نیز با عضویت در کمیته‌های مردمی در حراست از دست‌آوردهای انقلاب فعال بود. او در سال 1360 با همسری مؤمن ازدواج کرد و در هنگام شهادت یک پسر چهارماهه داشت.

با شروع شدن جنگ تحمیلی و غائله کردستان با گروه اعزامی از شهر خمین به فرماندهی برادر محمدرضا محمدی به جبهه‌های غرب کشور اعزام شد و نزدیک به سه ماه به عنوان بسیجی جندالله سپاه سقز در منطقه کردستان با علیه مزدوران و ضد انقلابیون داخلی می‌جنگید. مصطفی عاقبت در حین درگیری با گروهک‌های ضدانقلاب در سی‌ام مردادماه سال 1361 در منطقه سقز به درجه رفیع شهادت نائل آمد. پیکر مطهر شهید در گلزار شهدای شهر خمین به خاک سپرده شد.